「お前は今日から三か月後、一行瑠璃と恋人同士になる」 京都に暮らす内気な男子高校生・直実の前に、 10年後の未来から来た自分を名乗る青年・ナオミが突然現れる。 ナオミによれば、同級生の瑠璃は直実と結ばれるが、 その後事故によって命を落としてしまうと言う。 「頼む、力を貸してくれ。」 彼女を救う為、 大人になった自分自身を「先生」と呼ぶ、奇妙なバディが誕生する。 しかしその中で直実は、瑠璃に迫る運命、ナオミの真の目的、 そしてこの現実世界に隠された大いなる秘密を知ることになる。 世界がひっくり返る、 新機軸のハイスピードSF青春ラブストーリー。
“9·11”以后,经历了与恐怖分子战争的各发达国家,选择牺牲个人自由空间而建立起严格的管理体制,以此与恐怖袭击对抗,恐怖活动被扫荡一空。另一方面,欠发达国家发生内战和大规模屠杀的数量急剧增强,世界渐渐被一分而二。克拉维斯大尉率领的军事情报特殊搜索群i分队是唯一负责暗杀的特种部队。为了维系战斗时的心理状态,他们接受了“感情适应调整”、“痛感屏蔽”等医疗措施,更可以在瞬间读懂暗杀对象的心理活动并做出应对。作为精锐部队,他和部下从事暗杀在世界各地引起纷争的祸首的任务。这时,有一个叫约翰·保罗的人出现在暗杀名单中。这个神秘的语言学者造访过的国家必然出现将陷入混乱的兆头,半年内一定会发生内战和虐杀。而约翰行踪不定,看起像是在世界各地传播虐杀的种子。克拉维斯等人开始在人们最后看到约翰的布拉格展开调查,试图从与约翰接触过的其前学生露西娅身上打开突破口。克拉维斯向露西娅询问关于约翰的情况时,被她的魅力深深吸引。而在与约翰正面对峙的瞬间,克拉维斯了解了有关“引发屠杀的器官”的真相。