劇場版「金田一少年の事件簿」第2作で、前作から3年ぶりの公開だった。ストーリーは本作のために用意されたオリジナル編である。また小説家・京極夏彦や俳優の夏八木勲も声優として出演。およそ1万年前の海底遺跡に囲まれた沖縄の巨大リゾート、ディープブルー・アイランドのホテルに金田一一(はじめ)たちが招かれた。このリゾート開発を進める藍沢国際海洋開発の令嬢・茜は、キングシーサーと名乗る何者かから脅迫を受けていることを一に語る。
怪盗基德再度发出预告信,目标竟然是俄罗斯-罗曼诺夫王朝的皇室秘宝“记忆彩蛋”。柯南与服部联合保护“记忆彩蛋”,但把作案时间推理错误,令基德得逞,但基德于逃走中途被狙击。 自此引出一连串疑问,名侦探柯南,将于大阪解开一连串事件。
与毛利小五郎有关系的人逐个遭到不明凶徒的袭击。徒袭击后都会留下一张扑克牌,而被认为与曾任荷官且被毛利逮捕的村上丈有关。
柯南用新一的身份在电话不自愿地约会了小兰,陪她看5月3日的午夜场电影,以便请求小兰替他参加森谷帝二教授举办的茶会。柯南为此十分烦恼,不知如何掩饰他变小的事实。 柯南目送小兰离开后,为此烦恼的柯南接到一个电话,是来历不明的炸弹客挑战柯南!少年侦探团收到的引爆遥控飞机、被安装了炸弹的装小猫的篮子,还有环状线的的炸弹陷阱,大家奋力推理,才及时预防了可能发生的意外。可是,最后发现被安装了炸弹的其实是工藤新一和小兰的约会地点-米花町大楼!柯南该怎么办呢?.......
受到歌剧院老板黑泽和马的邀请,金田一、美雪和剑持警部再次造访歌岛。金田一不知为何有种不祥的预感,他的预感果然实现了。和怪人幽灵寄来的预告书一样,在密室状态下的剧场里饰演卡尔罗达的女演员遭到残杀,从此揭开了连续杀人的序幕! 漫画的第一部《歌剧院杀人事件》里只是稍微提到了老板的女儿黑泽美歌,而在这部小说里则担任了一个重要的角色。这种关联的趣味性以及密室和不在场诡计,使用只有在小说里才有办法展开的“叙述性诡计”,很值得一读。不过最能打动读者的心的,应该是凶手哀痛的告白吧。剧情感人肺腑,不愧是小说第一版的力作!而作为改编的电影版结尾自有一套峰回路转,千万也别错过哦!